電動車窗也是汽車上故障多發點之一，常見的故障有：車窗升不上去或降不下來；車窗玻璃自己掉落下來；車窗開閉困難或噪音很大。
引起這些故障的原因也很多，常見的有：控制開關故障、電機故障、車窗升降機構故障、玻璃托架故障等問題。
為了減少電動車窗引發的故障，正確使用和保養方式是每個愛車人必須掌握的技能。
電動車窗最常見的狀況是玻璃軌道內的橡膠條硬化或有污垢，致使玻璃上下不順暢或卡住不動。在這種情況下，應盡量保持車窗玻璃清潔，玻璃臟污不僅影響外觀和視野，而且可能影響電動車窗的動作。防止雨水流入車內，窗框上端附有橡膠帶，這也是與玻璃經常接觸的地方。玻璃遭受污損后與橡膠帶的摩擦增大，導致車窗開關受到影響，因此玻璃須經常保持干凈。平時可以噴些除濕防銹潤滑劑，以保證玻璃升降軌道內光滑、順暢。此外，應在電動車窗上的橡膠條上涂抹保養劑保持橡膠的韌性，防止出現干裂。
沒意識到，小小一個電動開關車的動作，涉及的耗電量很大，在慢車狀態時激活的一剎那甚至會使發動機聲音發生變化（因為耗電量增大導致發動機負荷加大）。因此，應當盡量減少車窗開閉次數，盡量避免同時開閉多個車窗，盡量不要在車窗已經關閉或下降到位時，依然按住控制按鈕不放。蓄電池容量較小的汽車車主更應該注意這一點。
在此，跟大家分享兩個簡單清理車窗的小方法：
第一，找到一個硬度較高的金屬片,用柔軟的布條把它包裹起來,將金屬片深入到車窗門縫里面,從一個固定的方向滑到另一個方向,切記不要來回滑動,直到布條完全變臟了,再換一塊干凈的布條繼續，如此操作,直到車窗門縫清理干凈為止。注意清理的時候不要用力過大,否則容易損壞車門窗的密封膠條；
第二，關閉所有車窗，對車內儀表噴蠟液,沿著導槽邊噴上蠟油,包括 在玻璃升降的時候接觸到的位置,都盡量噴涂上。然后,再把玻璃升降幾次,再繼續噴,讓玻璃帶著蠟油與導槽摩擦,進而把污物帶出來。再用棉花或者軟布把導槽內表面擦拭干凈,清理好污物清理出來，重點是窗戶的外側,因為大多數的污物都是隨著雨水從外側帶來的。
